smesh/src/SMDS/Notes

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2012-08-09 16:03:55 +06:00
--> Branche V6_main
Problemes en cours
==================
- a faire
+ en cours, OK mais perfectible
* OK
+ visualisation de groupe (type d'element): on voit tout le maillage, mais le groupe est OK
creation d'une structure vtkUnstructuredGrid locale : iteration un peu lourde, et pas de partage avec la structure du maillage (pas evident)
- inversion d'un volume (tetra): exception
- script de creation de noeuds et d'elements: OK, mais pas compatible avec version precedente (numerotation noeuds differente)
+ affichage numeros noeuds: numeros en trop sur (O,0,0) pas systematique, trouver la condition (enlever dans vtkUnstructuredGrid ?)
==> purge systematique noeuds et cellules en trop dans compactage grid.
+ gestion du mode embedded mal faite lors d'un script python : journal commandes intempestif
- affichage des noeuds apres changement lineaire <--> quadratique à l'IHM : pas pris en compte, alors que maillage OK,
mais script OK
==> cassé apres mode embedded ou elimination noeuds en trop ?
- extrusion elements 2D along a path : affichage apres calcul pas toujours OK (filaire)
- branche git a ouvrir pour merge avec V5_1_4_BR tag V5_1_4rc1
A tester, non pris en compte
============================
- engine standalone
- polyedres (attendre vtk)
=============================== Hypothese de refonte de l'API de SMDS
n'utiliser que vtkUnstructuredGrid, ne pas avor d'objets SMDS_MeshElement mais seulement des index de vtkUnstructuredGrid.
2987 usages de SMDS_MeshNodes
810 SMDS_MeshElement
...
==> en dernier ressort, lourd
================================================================================
Essai a API SMDS a peu pres constante
=====================================
SMDS_Mesh
static vector<SMDS_Mesh*> _meshList; --> retrouver un SMDS_Mesh
vtkUnstructuredGrid* myGrid;
vector<SMDS_MeshNode *> myNodes; --> meme index que dans le pointSet de myGrid
vector<SMDS_MeshCell *> myCells; --> index = ID client, pas le meme index que dans le cellTypes de myGrid (ID vtk)
SMDS_MeshElement
int myID; --> index dans la structure geree par SMDS_Mesh
int myMeshId; --> pour retrouver SMDS_Mesh* dans _meshList
int myShapeId; --> pour retrouver la subShape
SMDS_MeshNode: SMDS_MeshElement
SMDS_PositionPtr myPosition; --> A REVOIR : objet position dans la shape geom
##vector<int> myInverseElements; --> SUPPRIME : pour retrouver les elements, vtkCellLinks
SMDS_MeshCell: SMDS_MeshElement --> generique pour tous les elements (cells)
int myVtkID --> A SUPPRIMER
SMDS_MeshVolume: SMDS_MeshCell
SMDS_VolumeOfNodes: SMDS_MeshVolume --> Garder temporairement, utilisation dans StdMesher et SMDS_VolumeTool
const SMDS_MeshNode **myNodes; --> Couteux
int myNbNodes; --> ""
SMDS_VolumeVtkNodes: SMDS_MeshVolume --> Utiliser systematiquement dans SMDS,
--> IMPLEMENTER.
SMDS_MeshElementIDFactory: SMDS_MeshNodeIDFactory
vector<int> myIDElements; // index = ID client, value = ID vtk --> A SUPPRIMER, ne sert que dans SMDS_MeshElementIDFactory
vector<int> myVtkIndex; // index = ID vtk, value = ID client --> A REPORTER dans SMDS_Mesh
========= TODO ============
enlever vtkId de SMDS_MeshCell, utiliser SMDS_MeshElementIDFactory.
ajouter ID dans SMDS_Mesh::createTriangle
verifier ID dans SMDS_Mesh::Find*OrCreate
===================================================
occupation memoire cube 100*100*100 sans affichage
NOTES:
- sur Debian Sarge 64 bits, les mesures malloc_stat() semblent coherentes
avec une mesure externe globale(recherche du passage en swap du process).
- sur Ubuntu 9.10 64 bits, les mesures malloc_stat() donnent des resultats bizarres (surestimation ?),
mais la mesure avec l'outil KDE de surveillance systeme est OK avec la recherche du swap.
Reference : V513 Debian Sarge 64 bits: --> 463 - 33 = 430 Mo
-------------------------------------
Total (incl. mmap):
system bytes = 43757568
in use bytes = 32909584 = 33M
max mmap regions = 41
max mmap bytes = 16371712
----
Total (incl. mmap):
system bytes = 464670720
in use bytes = 463105120 = 463M
max mmap regions = 47
max mmap bytes = 28188672
Debian Sarge 64 bits, vtkUnstructuredGrid nodes et hexa, 4 janvier 2010 --> 512 - 41 = 471M
-----------------------------------
Total (incl. mmap):
system bytes = 52133888
in use bytes = 41340320 : 41M
max mmap regions = 72
max mmap bytes = 24625152
----
Total (incl. mmap):
system bytes = 520560640
in use bytes = 518735584 : 512M
max mmap regions = 88
max mmap bytes = 198385664
idem avec pool SMDS_MeshNodes --> 483 -33 = 450M
-----------------------------
Total (incl. mmap):
system bytes = 43696128
in use bytes = 32915184 : 33M
max mmap regions = 41
max mmap bytes = 16371712
----
Total (incl. mmap):
system bytes = 484806656
in use bytes = 482980992 : 483M
max mmap regions = 58
max mmap bytes = 184557568
idem ci-dessus + pool SMDS_VolumeVtkNodes --> 475 -33 = 442M (git: add ObjectPool.hxx)
-----------------------------------------
Total (incl. mmap):
system bytes = 43200512
in use bytes = 32908576 : 33M
max mmap regions = 41
max mmap bytes = 16371712
----
Total (incl. mmap):
system bytes = 478068736
in use bytes = 475144400 : 475M
max mmap regions = 59
max mmap bytes = 184692736
remplacement SMDS_PositionPtr: (boost::shared_ptr<SMDS_Position> --> SMDS_Position*) --> 436 - 35 = 401M (git SMDS_Position)
------------------------------------------------------------------------------------
Total (incl. mmap):
system bytes = 45408256
in use bytes = 35097680 : 35M
max mmap regions = 47
max mmap bytes = 18116608
----
Total (incl. mmap):
system bytes = 438935552
in use bytes = 436116560 : 436M
max mmap regions = 65
max mmap bytes = 186437632
simplification SMDS_SpacePosition (pas de double[3]) --> 418 -33 = 385M (git SMDS_SpacePosition)
----------------------------------------------------
Total (incl. mmap):
system bytes = 42582016
in use bytes = 32883552 : 33M
max mmap regions = 41
max mmap bytes = 16371712
----
Total (incl. mmap):
system bytes = 421728256
in use bytes = 418378000 : 418M
max mmap regions = 58
max mmap bytes = 183640064
sizeof(SMDS_MeshElement) 16
sizeof(SMDS_MeshNode) 24
sizeof(SMDS_MeshCell) 24
sizeof(SMDS_VolumeVtkNodes) 24
sizeof(SMDS_Position) 16
sizeof(SMDS_SpacePosition) 16
impact d'un int en plus dans SMDS_MeshElement --> 426 - 33 = 393M
---------------------------------------------
sizeof(SMDS_MeshElement) 24
sizeof(SMDS_MeshNode) 32 --> on retrouve bien les 8M
sizeof(SMDS_MeshCell) 24
sizeof(SMDS_VolumeVtkNodes) 24
sizeof(SMDS_Position) 16
sizeof(SMDS_SpacePosition) 16
Total (incl. mmap):
system bytes = 43192320
in use bytes = 32681088 : 33M
max mmap regions = 41
max mmap bytes = 16371712
----
Total (incl. mmap):
system bytes = 429334528
in use bytes = 426424576 : 426M
max mmap regions = 59
max mmap bytes = 184692736
remplacement std::set par std::vector dans SMESHDS_SubMesh --> 347 - 35 = 312M
----------------------------------------------------------
sizeof(SMDS_MeshElement) 24
sizeof(SMDS_MeshNode) 32
sizeof(SMDS_MeshCell) 24
sizeof(SMDS_VolumeVtkNodes) 24
sizeof(SMDS_Position) 16
sizeof(SMDS_SpacePosition) 16
Total (incl. mmap):
system bytes = 45404160
in use bytes = 35132160 --> 35M
max mmap regions = 49
max mmap bytes = 17723392
----
Total (incl. mmap):
system bytes = 349831168
in use bytes = 346885424 --> 347M
max mmap regions = 73
max mmap bytes = 204148736
Ce resultat est coherent avec une recherche de swap sur une machine a 8Go de memoire:
Cube a 270**3 mailles (~20M mailles) --> 6.2 Go (idem Debian Sarge et Ubuntu 9.10, 64 bits)
Le meme avec V5.1.3 --> 14 Go (swap)